尔时佛告曼殊室利：彼药师琉璃光如来行菩萨道时所发大愿，及彼佛土功德庄严①，我于一劫若过一劫，说不能尽，然彼佛土纯一清净，无诸欲染，亦无女人②及三恶趣苦恼之声，以净琉璃而为其地，城阙宫殿及诸廊宇，轩窗罗网皆七宝成，亦如西方极乐世界功德庄严。于彼国中有二菩萨，一名日光遍照，二名月光遍照③ ，于彼无量菩萨众中而为上首④，能持彼佛正法宝藏。 是故曼殊室利，若有净信男子女人，应当愿生彼佛世界。
　　〖注解〗
　　①庄严：以善美饰国土，或以功德饰衣身者，称为庄严。
　　②无女人：没有男女之相，一律平等，没有男女差别。
　　③一名日光遍照，二名月光遍照：东方净土，不但有药师如来，还有二菩萨，为其宣化的得力助手，一名日光遍照菩萨，二名月光遍照菩萨。
　　④上首：佛说法时，于听众中推居首位者，称为上首，或举一人为上首，或举多人为上首。
　　〖讲述〗
　　这时佛告诉曼殊室利说：那东方净土的世尊药师琉璃光如来，在因地修行菩萨道时，所发的广大悲愿，及成佛时，彼佛所有国土的殊胜功德，清净庄严，我就是用一劫或超过一劫的时间，也是说不详尽的。药师如来的净琉璃世界，一向都是清净的，没有各种世欲的污染，也没有女人苦痛及三恶趣苦恼的声音；换言之，东方药师乐土，一切都是大丈夫，没有男女相，一律平等；无恶趣，一切恶趣都是罪恶所感，而往生净土的众生，都已消除业障，善根具足；由此，也就没有苦痛的声音。以下，则是叙述净土的依报：药师如来的国土，地面是由琉璃宝所成，通明透亮；城台、楼阁、宫殿和房屋的飞檐以及窗户罗网都由七种宝物所饰成，一切功德庄严，与西方的极乐世界同样美好。在药师佛的国土中，有二菩萨辅弼，一名日光遍照，二名月光遍照，在那里的众多菩萨中列为上首，能够持修药师佛的正法宝藏，由于这个缘故，曼殊室利，凡是对药师法门有信心的善男子、善女人等，应当立定志愿，求生彼药师佛的净琉璃世界，不但资生物是无限的丰富，大众是非常的和乐，而且能受佛的教化开导，这样的法门，在十方净土中，也是难得希有的，应当发愿往生才是。

　　复次曼殊室利，若有众生，不识善恶，惟怀贪惜，不知惠施①及施果报②，愚痴少智，无有信心，多畜珍财，勤劳守护，见乞者来，心生不喜，设不获已，行惠施时，如割身肉，深生吝惜，复有无量悭贪有情，积集资财，然于自身尚不能用。况当供给父母、妻子、奴婢、仆使及来乞者。彼诸有情从此命终，生饿鬼中或傍生趣，由昔人间曾闻药师琉璃光如来名故，虽在恶趣③，还得忆念彼如来名，即于彼没，生在人中，得宿命智④，念畏恶趣苦⑤，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者，所有财物，无悭吝心，渐次尚能以头、目、手、足、血、肉、身分施来求者，况余财物。
　　〖注解〗
　　①惠施：亦即布施，以自己之所有施舍于人。布施有三类：一是财施，就是用财物去救济疾病贫苦的人。二是法施，就是用正法去劝人修善去恶。三是无畏施，就是不顾自己的安危去解除别人的怖畏。
　　②施果报：布施的果报。
　　③傍生处：即畜生。
　　④宿命智：亦译宿命念，念畏由于堕于恶趣之苦，生智而好行惠施。
　　⑤不乐欲乐：不再只为自己而乐于一己之欲乐中。
　　〖讲述〗
　　如来开示中，依正行愿已讲完；现说药师佛的善巧方便。药师如来，依过去因中的本愿力，及现证佛果的无边功德，救度一切苦难众生。度生主要是慈悲，而慈悲是内生的，须有高度的善巧方便，才能表现出来。这里讲的是另一大段，释迦复次告诉曼殊室利：若有众生不能辨识善恶，只怀著贪惜之心，不知布施和布施的果报，这实际是愚昧，缺少智慧，也没有信仰三宝四谛之心，只知多去积
畜财物，辛苦地对这些财物勤加守护，若见贫穷的人向他乞求衣食，就从心里厌烦而不喜欢。在不得已时行些布施，就如同割了他的身肉一般，深生吝惜。更有那些无量数的悭吝之人，只知积集资财，对于自身尚且舍不得受用，何况能去供养父母妻子和家里的佣人以及前来乞讨的人？这样的人等到从这个世界命终之后，必定要生饿鬼中或者是堕落于畜生。对于上述因贪吝而堕入恶趣的众生，由于往昔在人间的时候，曾经闻过药师琉璃光如来的名号，有意或无意中称念过，在心中留下了种子。所以当他堕入恶趣之中时，忽然忆得彼佛如来的名号，生恭敬心，至诚恳到皈向如来。凭此称念如来圣号的功德，即在这一念时，从彼三恶道中，还可以得受生人中，得到宿命智，念及畏惧恶趣之苦，彻底改变以往过失，不再为自己好乐私欲之乐，而能有利于他人，好行惠施，也赞叹别人的布施，对自己财物无悭吝心，渐次还能以自己的头、目、手、足、血肉、身分施于来乞者，更何况身外的财物？

　　复次曼殊室利，若复有人，归依世尊，受诸学处，而破戒破威仪及坏正见，设有持戒正见不求多闻，于佛所说契经深义①不能了解，虽有多闻②而怀矫慢，由慢心故，自是非他，嫌谤正法，为魔伴党。如是愚人自行邪见，复令无量百千俱胝③有情堕大险坑。此诸有情堕于地狱，傍生鬼趣。若曾闻此药师琉璃光如来名号，由彼如来本愿威力，于地狱中忆佛名号，从彼命尽，还生人间，正见精进④，意乐调善，舍俗出家，于佛法中受持学处无有毁犯，正见多闻，解甚深义，离于矫慢，不谤正法，不为魔伴，渐次修行诸菩萨行，乃至菩提。
　　〖注解〗
　　①契经深义：佛所说法，称当人情，契合法相，妙义重重， 深广如海。
　　②多闻：多听明师说法，多求知识开示。
　　③俱胝：亿数。
　　④精进：勤谓精进，乃勇猛修善法、断恶法。
　　〖讲述〗
　　释尊又告诉曼殊室利说：像这些众生，虽然归依世尊受持诸种戒律，却破坏了戒律威仪，毁坏了正见；对有持戒正见的人，又不求多闻，不多求知识开示，这样，对于佛所说的契经的深奥义理当然不能了解。有的人虽然不放弃多闻，却起了骄慢之心，觉得自己是对的，而认为别人不对。他是诽谤了正法，而成为魔鬼的伙伴了。像这样的愚人，不但自己行于邪见，还会使无量百千亿数的人堕入邪见的大险坑。这些人堕入地狱，傍生鬼道，受尽苦楚。若是听到这药师琉璃光如来的名号，由于如来的本愿威力，在地狱中忆念佛的名号，就能从那些恶道中命尽而还生于人间，得到了正见，继而精进修行，善能调服内心的意乐，进而舍俗出家，在如来的正法中，受持种种戒律，没有毁坏冒犯，而且起正见，求多闻，了解契经的甚深义理，远离骄慢之心，不再毁谤正法，不作魔鬼的同伴，这样渐渐一步步地修行诸菩萨的六度万行，乃至功德智慧都能获得。

　　复次曼殊室利，若诸有情悭贪嫉妒，造诸恶业，自赞毁他，命终当堕三恶趣中，无量千岁受诸剧苦。从彼终已，来生人间，或作牛马驼驴之属，恒被鞭挞饥渴缠心，身常负重，困苦疲极，若得为人，生居下贱，奴婢仆使，被他驱役，恒不自在。由昔人中曾闻药师琉璃光如来名号，彼善根力，今复忆念，至心归依，以佛神力，众苦解脱，诸根聪利，智慧多闻，恒求胜法，常遇善友，永断魔 羂，破无明壳①， 竭烦恼河。解脱一切生老病死忧悲苦恼，乃至菩提。
　　〖注解〗
　　①无明壳：鸡在未孵出时，闭在蛋壳内，是黑暗且不自由的。众生常为无明烦恼所困缚，有如鸡在壳内，所以破除无明，称为破无明壳。
　　〖讲述〗
　　释尊又告诉曼殊室利说：假若这些众生，悭贪忌妒，称赞自己、毁谤别人，命终之后就会堕入三恶道中，历经久远，受尽诸多的剧烈苦楚。从那里受完了剧苦之后，命终又降生到人间，或作牛马驼驴之类，常被鞭打，忍受饥渴缠心，身体常为人背负重担，困苦疲劳之极；即使可以降生为人，也还是居于下贱的地位，受他人的驱役使唤，总是不得自由。然而这些众生，若是在前世身为人的时候，曾经听闻世尊药师琉璃光如来的名号，就因为这以前的善因，现在又忆念起如来，并且一心一意地皈依药师如来，这时，佛便以伟大的神力，使众苦得到解脱，而且会使所有的根器变得聪利，智慧多闻，知道常常求取上胜的佛法，常常会遇到好的朋友，永远断除了魔外的邪见罗网，突破无明的蒙蔽，使烦恼的河流枯竭永不沉溺，解脱一切生老病死忧愁苦恼，乃至菩提。

　　复次曼殊室利，若诸有情，好喜乖离，更相斗讼，恼乱自他，以身语意①，造诸恶业，展转常为不饶益事，互相谋害，告召山林树冢等神，杀诸众生，取其血肉，祭祀药叉罗刹神②等；书怨人名或作形像，以恶咒术而咒诅之，厌魅蛊道，咒起死尸，令断彼命及坏其身；是诸有情，若得闻此药师琉璃光如来名号，彼诸恶缘悉不能害，一切展转皆起慈悲，利益安乐，无损恼意及嫌恨心，于自所有，常生喜足。
　　〖注解〗
　　①身语意：即身业、口业、意业，合称为三业。身业即身之所作所为，口业即口之所言，意业即意之所思。
　　②罗刹神：梵语，暴恶的意思，此是指吃人的鬼。
　　〖讲述〗
　　释尊又告诉曼殊室利说：好生是非，喜欢互相乖违离间，以致更相互诤讼，恼乱自己，又恼乱他人，以身、语、意造作种种恶业，展转报复，常为不利于人的事，并且互相谋害对方，如祷告山林树木以及冢墓间的鬼神，请他们代替报复；或杀牛羊鸡等众生，取其血肉，祭祀药叉、罗刹神等恶鬼；或书写仇人的名字，用草木作其形象，以恶毒的咒术咒诅他；或以邪术蛊道相害，对死尸念咒，使尸首活动起来，去断送仇人的性命，伤害他的身体。像这类受人毒害的有情，若是得以听到药师琉璃光如来的名号，便可承其慈悲威力，使那恶缘都不能为害，所有一切的恶意也都消解了，彼此之间展转慈心相处，而能相互增进种种利益，大家得到安乐，相互之间不再存有损恼意和嫌恨心，对于自己所受的果报，即使困难艰苦，也能产生欢喜满足之心。

　　复次曼殊室利，若有四众①：比丘、比丘尼、近事男、近事女及余净信男子女人，若能受持八支斋戒，或经一年，或复三月，受持学处②，以此善根，愿生西方极乐世界，见无量寿佛③。若闻药师琉璃光如来名号，临命终时，有八菩萨，乘神通来，示其去处，即于彼界种种杂色众宝④华中自然化生⑤，或有因此生于天上，虽生天中而昔善根亦不穷尽，不复更生诸余恶趣，天上寿尽还生人间，或为轮王⑥统摄四洲⑦，威德自在，劝化无量百千有情，于十善道令其修习；或生刹帝利婆罗门居士贵族，多饶财宝、仓库盈溢，形相端严，眷属隆盛，聪明智慧，勇健盛猛，有大身力。若是女人，得闻药师琉璃光如来名号，至心受持，于后不复更受女身。
　　〖注解〗
　　①四众：即比丘、比丘尼、优婆塞、优婆夷四者的合称。亦译为苾刍、苾刍尼、近事男、近事女。前二者为出家的男、女二众；后二者为在家亲近奉事三宝的男居士和女居士。
　　②学处：可学之处。为佛弟子修学之处所，即戒律。菩萨地 持经一曰：菩萨于何处学？ 学有七处：一者自利，二者利他，三者真实义，四者力，五者成熟众生，六者自熟佛法，七者无上菩提。
　　③无量寿佛：即阿弥陀佛，因阿弥陀佛的寿命无量。从时间说是无量寿，从空间上说是无量光。
　　④杂色众宝花：极乐国土的杂色宝花，如《阿弥陀经》说：大如车轮，青色青光，黄色黄光，赤色赤光，白色白光，微妙香洁。
　　⑤化生：四生（胎生、卵生、湿生、化生）之一，是无所依托，唯依业力而忽起者，如升诸天或下地狱者也。
　　⑥轮王：转轮圣王的简称，为世间第一有福之人。轮王出现时，天下太平，人民安乐，没有天灾人祸。
　　⑦四洲：为住须弥山四方咸海之四大洲。南方南赡部洲，东方东胜身洲，西方西牛货洲，北方北俱卢洲。
　　〖讲述〗
　　释尊又告诉曼殊室利说：若有四众佛弟子——比丘、比丘尼、近事男、近事女，以及其他净信佛法的善男子、善女人等，这些佛弟子有的能受持八支斋戒，或经一年之久，或于一、五、九三个月内，受持可学之处，以此受戒善根，有的愿意往生西方极乐世界，见无量寿佛，听闻弥陀如来及诸大菩萨开示正法，而未到根本定的众生，若是能闻得世尊药师琉璃光如来的名号，至心持念，临到命终时，即有八大菩萨——其名称文殊师利、观世音、得大势、无尽意、宝檀华、药王、药上、弥勒——这八大菩萨乘空而来，指示众生往生净土的道路，往生东方净土的众生，就在各种不同颜色相杂的宝华中，能够自然化生。或有众生，因为得闻药师如来名号，以此功德而生于天上。虽生天上受天福，而本有的生天善根也无穷尽，不会再堕于地狱等恶趣中。等到天上的寿命尽了，再降生人间，或者作为轮王统摄天下，威德极大，如意自在，能够劝化无量数的百千众生，在十善道中进行修行学习。或者生为刹帝利、婆罗门、居士、贵族，财宝很多，仓库充盈，形象生得端正庄严，眷属也都具足昌盛，具有聪明智慧、勇敢健强威猛无比，如同大力士那样；如果本来是女人，得闻药师琉璃光如来名号，至心领受奉持，便能于后来不再生为女身，以大丈夫身精进修行，向于佛果。

　　复次曼殊室利，彼药师琉璃光如来得菩提时，由本愿力观诸有情，遇众病苦瘦疟①干消②黄热③等病，或被魇魅蛊道所中，或复短命，或时横死，欲令是等消除所求愿满。时彼世尊入三摩地④，名曰灭除一切众生苦恼。既入定已，于肉髻⑤中出大光明⑥。光中演说大陀罗尼⑦咒曰：
　　〖注解〗
　　①瘦疟：古代叫劳伤病，为消耗性疾病。
　　②干消：我国医书中叫消渴症，口渴、肚饿、多饮、多食、多尿，一天天消瘦。
　　③黄热：即黄疸，身上温度高，皮肤眼睛发黄。以上这三种病，是当时流行很广的重症，故释尊举为例证，这均属生理上的病患。
　　④三摩地：梵语，又作三昧、三昧地等，是‘定’的意思。即住心于一境而不散乱的意思。
　　⑤肉髻：头顶上的肉髻，为佛的三十二相之一。
　　⑥光明：本体光亮谓之光，照物谓之明。称佛之光明者，是智慧相的表征。
　　⑦大陀罗尼：陀罗尼，梵语，总持的意思。其中含二义：一持，二遮；能摄持一切功德，遮障一切罪恶；也即是总一切法、持无量义。在佛经中，有文字陀罗尼、语言陀罗尼等多种，此处是咒陀罗尼，因其功用大，故名大陀罗尼。
　　〖讲述〗
　　释尊又告诉曼殊室利说：那东方药师琉璃光如来，当他成佛时，由于菩萨因地所发的本愿力——欲慈济一切众生的苦难，尤其是病苦，所以便以慧眼观察众生的病况，众生所遭遇的种种病苦，有瘦疟、干消、黄热等病，或被人用邪术暗中算计，使其神魂颠倒；或被蛊毒所中，而丧失生命；众生遭受这些病患与毒害，可能减短寿命，或死于非命。药师如来发大慈悲，要使众生一切病痛苦难皆得消除，因此众生向药师佛祈求消灾延寿的心愿，能够得到满足。那时候，药师世尊首先入定，叫作‘灭除一切众生苦恼’定。药师如来入定后，即于肉髻中放出大光明，在光明中演说大陀罗咒如下。

　　南谟①薄伽伐帝② 鞞杀社窭噜③ 薜琉璃④钵喇婆⑤ 曷啰阇也⑥ 怛他揭多也⑦阿啰𠿒帝⑧ 三藐三勃陀也⑨ 呾侄他⑩ 唵⑾ 鞞杀逝 鞞杀逝 鞞杀社⑿三没揭帝⒀ 莎诃⒁
　　〖注解〗
　　①南谟：又作南无，即皈依、皈命的意思。
　　②薄伽伐帝：即薄伽梵，也就是世尊。
　　③鞞杀社窭噜：药师的意思。
　　④薜琉璃：即是琉璃的意思。
　　⑤钵喇婆：光的意思。
　　⑥曷啰阇也：王的意思。
　　⑦呾他揭多也：如来的意思。
　　⑧阿啰𠿒 帝：应（供）的意思。
　　⑨三藐三勃陀也：正等正觉的意思。
　　⑩怛侄他：就是‘即说咒曰’的意思。
　　⑾唵：应读作嗡音，意义很多。⒈皈依义，即是集中身心而向于三宝；⒉警觉义：提起注意；也就是把精神集中起来，注意一个地方。
　　⑿鞞杀逝、鞞杀逝、鞞杀社：即是说，药之！药之！药！
　　⒀三没揭帝：即是普渡，普遍救度一切众生之义。
　　⒁莎诃：也作娑婆诃，意思就是速得成就。与‘急急如律令’相似。
　　〖讲述〗
　　向来以为咒是秘密藏，持念就好，不可求解这是因为咒义重重无尽，执一解就不圆满；其实大部分咒语还是可以作些基本解释，只有极少几句在可解与不可解之间。此咒上半讲的是皈依世尊药师琉璃光如来、应供、正等正觉，祈求加被；下半是说用药治疗一切众生病苦，希望立即经过普度迅速得到成就，解除病痛。
　　此咒大意为：皈命世尊药师琉璃光如来、应供、正等正觉。即说咒曰：嗡！药之，药之，药，普遍救度，迅速成就。

　　尔时光中说此咒已，大地震动①，放大光明。一切众生病苦皆除，受安隐乐。曼殊室利，若见男子女人有病苦者，应当一心为彼病人清净澡漱，或食或药，或无虫水②咒一百八遍，与彼服食。所有病苦悉皆消灭。若有所求，至心念诵，皆得如意，无病延年，命终之后生彼世界，得不退转，乃至菩提。是故曼殊室利，若有男子女人，于彼药师琉璃光如来，至心殷重，恭敬供养者，常持此咒，勿令废忘。
　　〖注解〗
　　①大地震动：唐华严经曰：‘以佛神力，其他一切六种十八相震动。’以示祥瑞。
　　②无虫水：即是无垢水，乃后夜由井中汲出，为奉佛之水（在水中放香花以供佛）。
　　〖讲述〗
　　当时，药师如来在光中说了此咒之后，大地都震动起来，而且普遍的放大光明，照耀一切众生，使一切众生的病苦皆得消除，过着安宁康乐的生活。释尊又告诉曼殊室利：若是看见男子或是女人，染到种种病苦，就应当一心为那病人，虔诚持诵药师如来神咒，为病人持诵此咒时，必须洗澡嗽口，常保持身口的清净。然后用病人吃的食物，或所服的药汤药丸，或用无垢的清净水，对着这些东西，持咒一百零八遍，然后给予病人服食。这样，病人所有的病苦便可皆得消灭。若有其他要求，能至心念诵药师神咒，也能够得到佛的加被护佑，得以无病延年，而且命终之后，凭此咒的神力也能展转引发功德，往生东方琉璃世界。只要往生东方净土，绝对不退转，乃至证得究竟大菩提果。以此之故，曼殊室利，若有男子或女人，对于那药师琉璃光如来，能至心殷实尊重，恭敬供养的，那么他对于此药师咒，应当常常受持诵念，不要让它废弃忘记。